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== Première Journée - Introduction à l'exploitation de masses de données au sein d'ICube ==
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== Deuxième Journée - Principaux Défis ==
  
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Une première journée aura lieu le '''18 octobre 2013 dans l'amphithéâtre A301 du Pôle API à Illkirch'''.
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Une deuxième journée aura lieu le '''7 novembre 2014 dans l'amphithéâtre A301 du Pôle API à Illkirch'''.
  
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De nombreuses équipes du laboratoire conçoivent et utilisent des méthodes et outils de calcul et de simulation. Ces outils demandent de plus en plus de données expérimentales (issues de capteurs, par exemple) et produisent un volume de plus en plus grand de données de résultats.
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Il s'agira :<br />
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* de présenter le défi Big Data dans le cadre des Données des Sciences et les "réponses" institutionnelles mises en œuvre pour aider les scientifiques à répondre à ce défi<br />
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* d'introduire deux problématiques communes à de nombreuses disciplines : la Sécurisation des données et leur Préservation<br />
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* de présenter quelques cas d'application concrets dans deux domaines : les Sciences de l'Environnement et les Sciences du Vivant<br />
  
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Devant ces masses de données, les méthodes classiques de gestion, de préservation et d'exploitation de telles données (bien souvent "manuelles") s'avèrent totalement dépassées.
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''Ce cycle est ouvert gratuitement à toute personne, scientifique ou non, concerné(e)s par ce défi, qu'il/elle soit membre ou non du laboratoire ICube.''
  
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L'objectif de cette journée est de présenter et discuter d'éléments de solution à cette problématique.
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==== Présentations Big Data : Le défi Mastodons ====
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* [[Media:Animinitex_Srasbourg_PierreG.pdf|Présentation de P. Gancarski : ''ANIMITEX - ANalyse d'IMages fondée sur des Informations TEXtuelles'']]
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* [[Media:Mastodons-iCUBE.pdf|Présentation de M. Bouzeghoub : ''Une approche interdisciplinaire des grandes masses de données'']]
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* [[Media:Seminaire_ICUBE_Novembre_2014.pdf|Présentation de JF. Boulicaut : ''AMADOUER - Analyse de MAsses de DOnnées de l'Urbain et l'Environnement'']]
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* [[Media:Privacy_big_data.pdf|Présentation de S. Gambs : ''Privacy in scientific data'']]
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* [[Media:CrEDIBLE-iCube-141107.pdf|Présentation de J. Montagnat : ''CrEDIBLE - fédération de données et de ConnaissancEs Distribuées en Imagerie BiomédicaLE'']]
  
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En particulier, nous vous proposons d'aborder le problème de l'exploitation des résultats de calcul et de simulation sous trois aspects :
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== Au programme :==
  
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*Visualisation de données surfaciques et volumiques issues de procédés de numérisation 3D (J.-M. Dischler):   La capacité de calcul et la flexibilité en matière de programmation des processeurs graphique (GPU)  a considérablement augmenté cette dernière décennie, mais les capacités de traitements par GPU pour la visualisation restent largement en dessous des très grands volumes de données fournis par les procédés de numérisation actuels : nuages de milliards de points. Nous illustrons nos contributions à travers deux exemples: le traitement et la visualisation de surfaces obtenues par scanners et appareils photo et la visualisation de données issues de procédés tomographiques (voxels). Dans les deux cas nos contributions visent à améliorer la performance en matière de qualité visuelle et de vitesse d'affichage.
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'''8h30 :''' Accueil<br />
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'''9h00 – 10h15 :''' Introduction<br />
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''Le défi « Big Data - Sciences des données »'' (60 minutes)
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:: Enjeux et défis scientifiques liés aux masses de données (Christine COLLET - LIG Grenoble)
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:: "Réponses", visions et actions du CNRS : Mastodons, MI, ... (Mokrane BOUZEGHOUB - DSA INS2I)  
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:: Le point sur le GDR MaDICS Masse de Données, Informations et Connaissances en Sciences (Christine COLLET, porteuse du projet de création)
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'''10h15 – 10h45 :''' Pause café<br />
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'''10h45 – 12h30 :''' <br />
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''Conférences'' <br />
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:: Défis pour le respect de la vie privée dans les données scientifiques et médicales (Sébastien GAMBS - IRISA Rennes)
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:: La préservation des données scientifiques (Cristinel DIACONU - Centre de Physique des Particules  Marseille)<br /><br />
  
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*Fouille de données (N. Lachiche) : il s'agira de présenter des concepts et méthodes permettant d'extraire de l’information des résultats d'expériences. Par exemple, comment trouver une ou plusieurs règles permettant de choisir au mieux un algorithme d'alignement multiple en fonction des caractéristiques des gènes à aligner ? Comment réduire l'espace de recherche des paramètres pour un algorithme de turbulence donné ? Des exemples en bioinformatique seront présentés
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Pause repas libre.<br /><br />
  
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*Métadonnées (C. Zanni-Merk ) : L'exploitation des résultats de calcul nécessite bien évidement de les préserver (et d'être capable de les retrouver à l'aide de critères simples de recherche) mais aussi de préserver le contexte dans lequel chacun d'eux a été produit. Par exemple, la date, les données et paramètres utilisés, l'utilisateur mais aussi éventuellement des critères sur la fiabilité sur l'algorithme, sur la qualité des données, sur l'expertise de l'utilisateur, etc. Il s'agira ici de présenter les grands lignes de la mise en place de métadonnées. Un exemple de mise en place de telles données dans le cadre de la Géographie sera présenté
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'''13h45 – 15h15:'''  ''ICube et les principaux défis  « Big Data »''
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:: Sciences du vivant (Olivier Poch)
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:: Science de l'environnement (Florence Leber)
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'''15h15 – 15h45 :''' Pause<br />
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'''15h45 - 17h45 :''' ''Projet MASTODONS'' (30 minutes) liés à ces défis :
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:: Projet « Défis computationnels des séquençages et phénotypage haut débit en science de la vie » (Eric RIVALS - LIRMM Montpellier)
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:: Projet « AMADOUER : Analyse de MAsse de DOnnées de l’Urbain et l’EnviRonnement » (Jean-François BOULICAUT - LIRIS Lyon )
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:: Projet « ANIMITEX : Analyse d’images fondées sur des informations textuelle (Mathieu ROCHE - TETIS Montpellier)
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:: Projet « CrEDIBLE : fédération de données et de ConnaissancEs Distribuées en Imagerie BiomédicalE » (Johan MONTAGNAT - I3S Nice)
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'''17h45 :''' Table ronde, Bilan de la journée, Actions futures<br />
  
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La journée prendra la forme d'une présentation de quelques minutes de chacun de ces aspects suivie d'une table ronde.
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[[Image:TOP-BIG-DATA.jpg|center|300px|Image Big Data]]
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<center><small>''©Ben Chams-Fotolia''</small></center>
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[[Image:Para234049.jpg|center|300px|Image Big Data]]
 
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Version actuelle datée du 8 janvier 2016 à 12:16

Deuxième Journée - Principaux Défis

Une deuxième journée aura lieu le 7 novembre 2014 dans l'amphithéâtre A301 du Pôle API à Illkirch.

Il s'agira :

  • de présenter le défi Big Data dans le cadre des Données des Sciences et les "réponses" institutionnelles mises en œuvre pour aider les scientifiques à répondre à ce défi
  • d'introduire deux problématiques communes à de nombreuses disciplines : la Sécurisation des données et leur Préservation
  • de présenter quelques cas d'application concrets dans deux domaines : les Sciences de l'Environnement et les Sciences du Vivant

Ce cycle est ouvert gratuitement à toute personne, scientifique ou non, concerné(e)s par ce défi, qu'il/elle soit membre ou non du laboratoire ICube.

Présentations Big Data : Le défi Mastodons

Au programme :

8h30 : Accueil
9h00 – 10h15 : Introduction
Le défi « Big Data - Sciences des données » (60 minutes)

Enjeux et défis scientifiques liés aux masses de données (Christine COLLET - LIG Grenoble)
"Réponses", visions et actions du CNRS : Mastodons, MI, ... (Mokrane BOUZEGHOUB - DSA INS2I)
Le point sur le GDR MaDICS Masse de Données, Informations et Connaissances en Sciences (Christine COLLET, porteuse du projet de création)

10h15 – 10h45 : Pause café
10h45 – 12h30 :
Conférences

Défis pour le respect de la vie privée dans les données scientifiques et médicales (Sébastien GAMBS - IRISA Rennes)
La préservation des données scientifiques (Cristinel DIACONU - Centre de Physique des Particules Marseille)

Pause repas libre.

13h45 – 15h15: ICube et les principaux défis « Big Data »

Sciences du vivant (Olivier Poch)
Science de l'environnement (Florence Leber)

15h15 – 15h45 : Pause
15h45 - 17h45 : Projet MASTODONS (30 minutes) liés à ces défis :

Projet « Défis computationnels des séquençages et phénotypage haut débit en science de la vie » (Eric RIVALS - LIRMM Montpellier)
Projet « AMADOUER : Analyse de MAsse de DOnnées de l’Urbain et l’EnviRonnement » (Jean-François BOULICAUT - LIRIS Lyon )
Projet « ANIMITEX : Analyse d’images fondées sur des informations textuelle (Mathieu ROCHE - TETIS Montpellier)
Projet « CrEDIBLE : fédération de données et de ConnaissancEs Distribuées en Imagerie BiomédicalE » (Johan MONTAGNAT - I3S Nice)

17h45 : Table ronde, Bilan de la journée, Actions futures

Image Big Data
©Ben Chams-Fotolia
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